新建系館--「食品暨生物科技大樓」於原地點與生物科技學研究所合建，全棟樓高八層，樓層面積共計3255坪，其中食品暨應用生物科技學系佔1800坪，生物科技學研究所1000坪，其餘為學校所屬公共面積，工程已於2004年底完成。

食品暨生物科技大樓為八層樓之建築物，建坪共計3255坪。一樓為教學空間，除大學部及研究所教室、學生實習教室外，另有會議室及大型視聽教室。二至五樓本系專用，有系辦公室、大小討論室、公用儀器室及各教師之研究實驗室。食品加工實習工廠為一棟二層樓之建築物，內設辦公室、實習工廠、現代化調理室、大型冷凍冷藏庫及各種研究室。供全系師生進行教學、研究、實習之用。

同時為培養具有人文氣息的食品生物科技專家，本系在各樓層擺設許多藝術畫作，期以在潛移默化中，提升師生們的藝術氣息，並增加對本系的歸屬感。